Cat Data


BEGIN DATA; 
DIMENSIONS NTAX=17 NCHAR= 363; 
FORMAT INTERLEAVE MISSING=?  GAP=- MATCHCHAR=.  DATATYPE=DNA; 
MATRIX 
[ 111 111 111 122 222 222 223 333 333 333 444 444 444 455 123 456 789
012 345 678 901 234 567 890 123 456 789 012 345 678 901 ]
Domestic  ATG ACC AAC ATT CGA AAA TCA CAC ACC CTT ATC AAA ATT ATT AAT CAC TCA 
African   ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... 
European  ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ..C ... ... 
Nafrican  ... ... ... ... ... ... ... .C. C.T ... ... ... ... ... ..C ... ... 
Jungle    ... ... ... ... ... ... ... ... C.T ..C ... ... ... ... ..C ... ... 
BlackFoot ... ... ... ... ... ... ... .C. C.. ... ..T ... ..C ... ..C ... ... 
Lion      ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ..C ..C ... ... ... 
Cheetah   ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ..C G.. ... ... ... 
Geoffroy  ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ..C ... ... 
Kodkod    ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ..C ... ... ... 
Margay    ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... G.T ... ... ... ... ... ... 
Ocelot    ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... 
Pampas    ... ... ... ... ... ... ... ... CT. ... ..T ... ... ... ..C ... ... 
Tigrina   ... ... ... ... ... ... ... ... C.T ... ..T ... ... ..C ..C ... ... 
Hyaena    ... ... ... ... ... ... ..T ... C.A ..C ..T ... ... ..C ..C A.A ... 
Mongoose  ... ... ... ..C T.. ..G ..T ... C.G ..C ... ... ..C ..C ... A.G ..G 
Fanaloka  ... ... ... ..C ... ... ... ... C.A ... ... C.. ... ..C ..C G.A ...  
[ 111 555 555 556 666 666 666 777 777 777 788 888 888 889 999 999 999
000 234 567 890 123 456 789 012 345 678 901 234 567 890 123 456 789
012 ]
Domestic  TTC ATC GAC CTA CCC GCC CCA TCT AAC ATC TCA GCA TGA TGA AAC TTC GGC
African   ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
European  ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... 
Nafrican  ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Jungle    ... ... ..T T.. ... ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... 
BlackFoot ... ... ..T ... ..T A.. ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... 
Lion      ... ..T ..T ..T ..T ..T ... ..C ..T ... ... ... ... ... ... ..T ... 
Cheetah   ... ... ..T T.. ... A.. ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... ... ... 
Geoffroy  ... ..T ..T ... ..T ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... 
Kodkod    ... ..T ..T ... ..T ... ..G ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Margay    ... ... ... ... ... ..T ..G ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... 
Ocelot    ... ... ... ... ... ..T ... ..C ... ... ... ... ... ..G ... ... ... 
Pampas    ... ..T ..T ... ..T ... ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... 
Tigrina   ... ... ..T ... ..T A.. ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ..T ... 
Hyaena    ... ..T ... ..C ... A.. ... ..C ... ... ..G ... ..G ... ..T ... ..G 
Mongoose  ... ... ... ..C ... ..T ... ..C ... ... ... ... ..G ... ... ... ... 
Fanaloka  ... ... .G. ..C ... ..T ..C ..C ..T ..T ... .G. ... ..G ... ... ...
[111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111
000 000 011 111 111 112 222 222 222 333 333 333 344 444 444 445 555
345 678 901 234 567 890 123 456 789 012 345 678 901 234 567 890 123 ]
Domestic  TCC CTT CTA GGA GTC TGC CTA ATC TTA CAA ATC CTC ACC GGC CTC TTT TTG
African   ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
European  ... ... ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... ... 
Nafrican  ... ..C ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Jungle    ... ..C ... ... A.. ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... C.A
BlackFoot ..T ..C T.. ... A.. ... ... ... C.G ... ... ... ... ... ..A ... C.A 
Lion      ... ..G ... ... ..A ..T T.. ... C.. ... ..T ... ... ... ... ... C.A 
Cheetah   ... ..A ... ... ... ... ... G.. C.. ..G ... ..A ... ... ..T ..C C.A 
Geoffroy  ... T.A ... ... ... ... ... ... C.. ... ... ..T ... ... ..T ..C C.A
Kodkod    ... T.A ... ..T ..A ... ... ... C.. ... ..T ..T ... ... ..T ..C C.A 
Margay    ..T T.A T.. ..G A.T ... ... ... C.. ... ..T ... ..T ... ..T ..C C.. 
Ocelot    ... T.A T.. ... ..T ... ... ... C.. ... ... ... ... ... ... ... C.. 
Pampas    ... T.A T.. ... A.T ... ... ..T C.. ... ..T ..T ..T ... ... ..C C.A 
Tigrina   ... T.A T.. ... A.T ... ... ..T C.. ... ..T ..T ..T ... ... ..C C.A
Hyaena    ..A ..A T.. ... A.. ... T.. ... ... ... ... ..G ..A ..T ..A ..C C.A 
Mongoose  ..T ..A ... ... ... ... ... ... C.. ... ..T ..A ..A ..T ..A ..C C.. 
Fanaloka  ... ..A ... ... ..A ..T T.G ..T C.? ... G.. ..G ..A ... ..A ..C C..  
[111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 111 122 222
555 555 666 666 666 677 777 777 778 888 888 888 999 999 999 900 000
456 789 012 345 678 901 234 567 890 123 456 789 012 345 678 901 234 ]
Domestic GCC ATA CAC TAC ACA TCA GAC ACA ATA ACC GCC TTT TCA TCA GTT ACC CAC 
African   ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
European  ... ... ... ... ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Nafrican  ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Jungle    ... ..G ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... ..G ... ... ..T ... 
BlackFoot ... ... ..T ..T ... ... ... ... ..G ... ... ..C ... ... ... ..A ... 
Lion      ... ... ..T ... ... ... ... ... T.. ... ..T ..C ... ... ..C ... ..T 
Cheetah   ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ... 
Geoffroy  ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ..C ..G ... ..C ..T ... 
Kodkod    ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ..G ... ..C ..T ... 
Margay    ... ... ... ..T ... ... ... ... GC. ... ..T ... ... ... ... ... ... 
Ocelot    ... ... ... ..T ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ... ..T ... 
Pampas    ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ..C ... ... 
Tigrina   ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ... ... ... ..C ... ... 
Hyaena    ... ... ... ... ... ... ... ... .C. ... ... ..C ... ... ..G ... ... 
Mongoose  ... ... ... ... ... ... ... ... G.. ..A ... ..C ... ... ..A ..T ... 
Fanaloka  ..A T.. ..? ... ... ... .G. ... GC. C.. .G. ..C ... ... ..A ... ... 
[222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222
000 001 111 111 111 222 222 222 233 333 333 334 444 444 444 555 555
567 890 123 456 789 012 345 678 901 234 567 890 123 456 789 012 345 ]
Domestic  ATC TGT CGC GAC GTT AAT TAT GGC TGA ATC ATC CGA TAT TTA CAC GCC AAC
African   ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
European  ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Nafrican  ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..G ... ... ... 
Jungle    ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... A.G ... ... ... 
BlackFoot ..T ... ... ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ..C A.. ..T ... ... 
Lion      ..T ..C ... ... ..A ... ... ... ... ..T ... ... ... C.. ... ... ... 
Cheetah   ... ..C ... ... ..C ..C ..C ... ... ..T ..T ... ..C A.G ... ... ... 
Geoffroy  ... ..C ..T ... ..C ..C ..C ... ... ..T ... ... ..C A.. ..T ..T ... 
Kodkod    ... ..C ... ... ..C ..C ... ... ... ..T ... ... ... A.. ..T ..T ... 
Margay    ... ..C ... ... ..C ..C ..C ... ... ... ... ... ..C A.. ..T ... ... 
Ocelot    ... ..C ..T ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ..C A.. ..T ... ... 
Pampas    ... ..C ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ..T ... ..T 
Tigrina   ... ..C ... ... ..C ..C ... ... ... ... ... ... ... A.. ..T ... ..T 
Hyaena    ... ..C ..A ... ..A ..C ..C ... ... ... ... ... ..C A.. ... ... ... 
Mongoose  ... ..C T.T ..T ..C ..C ..C ... ..G ..T G.. ..G ... A.. ..T ..T ... 
Fanaloka  ... ..G ..G ... ..C .CA ..C ..G ... ..? ... ..G ... A.. ..T ... ..T 
[222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 223 333 333
555 566 666 666 667 777 777 777 888 888 888 899 999 999 990 000 000
678 901 234 567 890 123 456 789 012 345 678 901 234 567 890 123 456 ]
Domestic  GGA GCT TCT ATA CTC TTT ATC TGC CTG TAC ATA CAT GTA GGA CGG GGA ATA 
African   ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ... ... ... 
European  ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Nafrican  ... ... ... ... T.. ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Jungle    ... ..C ..C ... T.. ... ... ... ... ... ... ..C ... ... ..A ... ... 
BlackFoot ... ... ..C ... T.. ..C ... ... T.A ..T ... ... ... ... ..A ... ... 
Lion      ... ..C ..C ... T.. ... ... ... ..A ... ..G ... ... ... ..A ... ... 
Cheetah   ... ..C ... ... T.. ... ... ... ..A ... ..G ... ... ... ..A ... ... 
Geoffroy  ... ..C ..C ... T.. ... ... ... ..A ... .CG ..C ... ... ..A ... ... 
Kodkod    ..G ..C ..C ... T.. ... ... ... ..A ... .C. ..C ... ... ... ... ... 
Margay    ... ..C ..C ... T.T ... ... ... ..A ... ... ..C ... ..G ..A ... ... 
Ocelot    ... ..C ..C ... T.T ... ... ... ..A ... ... ..C ... ..T ..A ... ... 
Pampas    ... ... ..C ... T.. ..C ... ... ..A ... ... ..C ... ... ..A ... ... 
Tigrina   ... ... ..C ... T.. ..C ... ... ..A ... ... ..C ... ... ..A ... ... 
Hyaena    ... ... ..C ... T.. ..C ... ..T ..A ..T ... ... A.C ..C ..A ... ... 
Mongoose  ... ..C ... ... T.. ..C ... ... ..A .T. ..G ... ... ..T T.A ..C ... 
Fanaloka  ... ..C ..C ... T.. ... ... ... ..A .TT ..G ... ..C ..C ..A ..C ..G
[333 333 333 333 333 333 333 333 333 333 333 333 333 333 333 333 333
000 111 111 111 122 222 222 223 333 333 333 444 444 444 455 555 555
789 012 345 678 901 234 567 890 123 456 789 012 345 678 901 234 567 ]
Domestic TAC TAC GGC TCC TAC ACC TTC TCA GAG ACA TGA AAC ATT GGA ATC ATA CTA 
African   ... ... ... ... ... ... ... ... A.. ... ... ... ... ... ... ... ... 
European  ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Nafrican  ..T ... ... ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... ... 
Jungle    ..T ..T ... ... ... ... ... ... ... ... ... ..T ..C ... ... ... ... 
BlackFoot ..T ... ... ..T ... ..A ... CT. ... ... ... ..T ... ... ... G.. ... 
Lion      ... ... ... ... ... ..T ... ... ..A ... ..G ..T ... ... ... G.. ... 
Cheetah   ... ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ..T ... ... ... ... ... 
Geoffroy  ... ... ... ... ... ... ..T ... ..A ... ... ... ..C ... ..T G.. ..G 
Kodkod    ... ... ... ... ... G.. ... ... ..A ... ... ..T ..C ... ..T ... ... 
Margay    ..T ... ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ..T ... ..G 
Ocelot    ..T ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ... ... ..G 
Pampas    ... ... ... ... ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... ... ... G.. ... 
Tigrina   ... ... ... ... ... ..T ... ... ..A ... ... ... ... ... ... G.. ... 
Hyaena    ... ... ..A ..T ... ..A C.. C.. ... ..G ... ... ..C ... ... C.. ... 
Mongoose  ... ..T ... ... ... ... ... ... ..A ... ... ... ..C ... ..T G.T ..G 
Fanaloka  ... ..T ... ..A C.. ... ... ... ..A ... ... ... ... ..G ..T C.T ..G
[333 333 556 666 890 123]
Domestic  TTA TTT
African   ... ...
European  ... ...
Nafrican  ... ...
Jungle    C.. ...
BlackFoot C.. ...
Lion      ... ..C
Cheetah   C.. C.C
Geoffroy  C.. ...
Kodkod    C.. ...
Margay    C.. ...
Ocelot    C.. ..C
Pampas    .AT ..A
Tigrina   ... ...
Hyaena    C.. ..C
Mongoose  C.. ...
Fanaloka  C.. ..C
;
ENDBLOCK;